Onderzoekers stippelen richtlijnen uit voor volledige genoomsequencing als enige methode voor de diagnose, de behandeling en de detectie van tuberculose.
Verschillende methoden worden momenteel gebruikt voor het detecteren, behandelen en traceren van tuberculose (TB), die allemaal zouden kunnen worden vervangen door sequentiebepaling van het gehele genoom (WGS). In Nature Reviews Microbiology beschrijft een groep onderzoekers onder leiding van Dr. Conor Meehan van het Instituut voor Tropische Geneeskunde Antwerpen (ITM) de voordelen en risico’s van de moderne technologie voor het bepalen van genoomsequenties, die in toenemende mate wordt gebruikt. De onderzoekers bieden een reeks aanbevelingen om internationaal te standaardiseren in klinische zorg en volksgezondheid.
De diagnose, behandeling en het volgen van Mycobacterium tuberculosis , de bacterie die TB veroorzaakt, wordt momenteel gedaan door verschillende technieken. Met de komst van goedkope en betrouwbare WGS zouden deze verschillende technieken kunnen worden vervangen door één enkele methode. Het risico bestaat echter dat, zonder duidelijke consensus en zonder internationale normen, het wijdverbreide gebruik van WGS-technologie kan leiden tot gegevens en processen zonder harmonisatie, vergelijkbaarheid en validatie.
“We pleiten voor uitgebreide standaardisatie- en validatie-inspanningen voordat we de WGS-aanpak op grote schaal implementeren”, zei dr. Conor Meehan. “Dat vereist een politiek engagement en ook de betrokkenheid van supranationale laboratoria en regelgevende instanties.Het is belangrijk om de toegang tot gestandaardiseerde en gevalideerde WGS-technieken te garanderen, vooral in landen met een hoge TB-last en waar WGS de grootste impact zal hebben.”
Dr. Conor Meehan van ITG samen met Dr. Inaki Comas van het Biomedicine Instituut van Valencia en Prof dr Annelies Van Rie van de Universiteit van Antwerpen stichtten een consortium van meer dan 40 internationale wetenschappers met tbc-expertise. Door samen te werken beschreven zij de state-of-the-art van WGS in Mycobacterium tuberculosis en formuleerden een reeks aanbevelingen. Deze aanbevelingen zijn van bijzonder belang in het licht van internationale ontwikkelingen. “Momenteel worden WGS-technieken vooral gebruikt in onderzoeksactiviteiten, maar de methode breidt zich snel uit naar klinische zorg en hulpmiddelen voor de volksgezondheid om de verspreiding van tuberculose in kaart te brengen. Een gestroomlijnde methode en gestandaardiseerde rapportage worden met de dag belangrijker “, aldus Meehan.
WGS wordt al aanbevolen door de Wereldgezondheidsorganisatie als een standaardtechniek voor wereldwijde drugresistentieonderzoeken en wordt ook steeds vaker gebruikt als een methode om gepersonaliseerde behandeling te bieden. Meer en meer landen implementeren WGS-technieken.
Tuberculose is een bacteriële infectie die jaarlijks ongeveer 1,6 miljoen mensen doodt, waardoor het wereldwijd een van de tien belangrijkste doodsoorzaken is. ITG’s onderzoek naar tuberculose is wereldberoemd. Het instituut heeft de grootste openbare verzameling tbc-stammen voor onderzoek. Het zorgde voor een doorbraak met een kortere combinatiebehandeling voor resistente tuberculose en onderzoekt nieuwe diagnostische en casedetectietechnieken.
LINK: Hele genoomsequentiebepaling van Mycobacterium tuberculosis : huidige normen en openstaande kwesties (Nature Reviews Microbiology)
Foto: Mycobacterium tuberculosis (www.itg.be)